农产品深加工因为使用最高的增值税税率，所以这几年对于农产品的抵扣得给予了加计扣除的待遇，比如现行农产品深加工税率为16%，农产品的进项税额可以在抵扣10%的基础上可以再加计扣除2%，相当于抵扣12%。
但是4月1日起，增值税税率进行了大幅度下调，农产品深加工的税率降为了13%，初级农产品税率降为了9%，而深加工行业取得的进项发票也降为了可以抵扣10%，相当于在抵扣9%的基础上加计扣除1%。请看文件截图：
这样的话，就从原来的销项16%、进项12%降为了销项13%、进项10%，总体上还是有利于深加工农产品价格的降低。
那么关于深加工行业申报表附表二的填写和以前变化不大，只是税率的调整
进项税额合计为(10000 5000 5000 3000)*0.09 (10000 5000 5000 3000)*0.01=2300元。
附表二第一行填写金额10000，税额900，第六栏填写金额13000，税额1170，8a栏次填写230。
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